A Kolozsvári Magyar Szakkollégiumi Központ létrehozását célzó program két részből áll: egyrészt a szükséges infrastruktúra megteremtése, másrészt az oktatási és kutatási programok megszervezése. Ez utóbbi a szakkollégiumi oktatást, a tutoriális programok és a speciális képzési formák működtetését jelenti.

A 2004/2005-ös egyetemi évben az oktatási és kutatási programok megszervezése, beindítása volt a cél. Ennek megfelelően 14 szakterületet (biológia– ökológia geológia, filozófia, irodalomtudomány, jogtudomány, közgazdaságtudomány, matematika–informatika, művészettörténet, néprajz, politológia, régészet, szociológia) lefedő 11 szakkollégium kezdte el működését.

A 2005/2006 évben ez 16, a 2006/2007-es tanévben 19, a 2007/2008-es tanévben 21, illetve a 2008/2009-es tanévben 22 szakkollégiumra bővült. Jelenleg pedig, a BBTE és a KMEI tagszervezeteinek hálózatában a következő szakkollégiumok működnek:

A KMEI Szakkollégium programjában szereplő szakkollégiumok:

• Alkalmazott-didaktika Szakkollégium – Pszichológia és Neveléstudományok Kar
• Apáthy István Szakkollégium – Biológia és Geológia Kar, biológia és ökológia szakok
• Balogh Artúr Szakkollégium – Politika-, Közigazgatás- és Kommunikációtudományi Kar
• Cholnoky Jenő Földrajz Szakkollégium – Földrajz Kar; honlap: www.cholnoky.ro
• Entz Géza Szakkollégium – Történelem és Filozófia Kar
• Erdélyi Római Katolikus Státus Szakkollégium – Római Katolikus Teológiai Kar
• Farkas Gyula Szakkollégium – Matematika és Informatika Kar; honlap: www.cs.ubbcluj.ro/»bittologatok
• Fizika Szakkollégium – Fizika Kar; honlap: atom.ubbcluj.ro/szakkoll
• Julesz Társaság - Képzőművészeti Egyetem
• Kémia Szakkollégium – Kémia és Vegyészmérnöki Kar
• Közgazdasági Kutató Klub – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar
• Kriza János Szakkollégium – Bölcsészettudományi Kar
• Láthatatlan Kollégium – Bölcsészettudományi Kar
• MATUR Szakkollégium - Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar
• Márton Gyula Nyelvészeti Szakkollégium – Bölcsészettudományi Kar
• Max Weber Szociológiai Szakkollégium – Szociológia és Szociális Munkás Kar
• Menedzsment Szakkör – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar
• Mikó Imre Jogi és Közgazdasági Szakkollégium – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar
• Pokoly József Szakkollégium – Református Tanárképző Kar
• Politikai Marketing Szakkollégium – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi és Politika-, Közigazgatás- és Kommunikációtudományi Karok
• Pósta Béla Szakkollégium – Történelem és Filozófia Kar
• Pro Philosophia Szakkollégium – Történelem és Filozófia Kar
• Spectator Média Szakkollégium – Politika-, Közigazgatás- és Kommunikációtudományi Kar
• Történelem Szakkollégium – Történelem és Filozófia Kar